Teadus: paljastab autismiga seotud närvirakkude tüübid

Uues uuringus on teadusuuringute asutuste, näiteks San Francisco California ülikooli (USA, San Francisco, California, USA) teadlaste teadlased surnud rohkem kui 100 000, autismispektri häirega (ASD) inimeste surmajuhtumid ja ilma ASDta inimesed. Tagaajurakkude tuumajärjestus tuvastas geenitüübid, mida selle haiguse puhul aberrantselt reguleeritakse, ja rakutüübid, mis sellist aberrandset regulatsiooni läbivad. Need tulemused aitavad kitsendada tulevaste ASD-uuringute fookust kõige tõenäolisemate molekulaarsete ja rakuliste kõrvalekallete suhtes. Vastavad uurimistulemused avaldati ajakirjas Science 17 2019 mais ja artikli pealkiri oli 0010010 quot; Üherakuline genoomika identifitseerib rakutüübispetsiifilisi molekulaarseid muutusi autism 0010010 quot ;.

Pilt teadusest, 2019, doi: 10. 1126 / science.aav 8130.

0010010 quot; Ta kasutab uusimat tehnoloogiat, viib läbi uuringuid ühe kambri tasemel, valideerib ja laiendab varasemaid vaatlusi, 0010010 quot; ütles Los Angelese California ülikooli autismi uurija Daniel Geschwind (uues uuringus ei osalenud). Varasemad uuringud on viinud meid lahenduseni, mida me pole kunagi varem saavutanud. 0010010 quot;

San Francisco California ülikooli geneetik Stephan Sanders (uues uuringus ei osalenud) lisas: 0010010 quot; See on katse, mis tuleb läbi viia. Organisatsiooni tasandil kordab see üldjoontes varasemaid uurimusi autismi kohta. . Seejärel vaadeldi esimest korda, millised rakutüübid neid erinevusi tekitasid. 0010010 quot;

Praegu on ASD esinemissagedus lastel Ameerika Ühendriikides umbes 1 60. See haigus hõlmab mitmesuguseid haigusseisundeid, mida iseloomustavad halvenenud suhtlus- ja sotsiaalsed oskused. ASD heterogeensus raskendab selle molekulaarse patoloogia uurimist. Esimene autor Dmitri Velmešev, California ülikooli San Francisco neuroloog Arnold Kriegsteini laboratooriumi järeldoktor tuvastatud rajad, mida tavaliselt mõjutatakse, sealhulgas sünaptiline funktsioon.

Sanders tõi välja, et varasemad uuringud on lisaks soovitanud neuronaalse geeni ekspressiooni vähenemise ja gliaalrakkude geeni ekspressiooni suurenemise tendentsi ASD-s. Siiski selgitas ta, 0010010 quot; On ebaselge, kas need muutused tähistavad erinevusi raku selles osas (näiteks suhteliselt vähe neuroneid) või rakus esinevaid geneetilisi kõrvalekaldeid. 0010010 quot;

Velmeshev selgitas, et selle põhjuseks on 0010010 quot; see, mida inimesed teevad, on palju geeniekspressiooniuuringuid, mis tähendab, et konkreetsete rakutüüpide uurimiseks pole otsest viisi. 0010010 quot; Täna, kasutades äsja väljatöötatud sekveneerimise tehnoloogiat, mida nimetatakse ühetuumaliseks RNA sekveneerimiseks, on Velmeshev ja tema kolleegid testinud enam kui 50 000 üksiku raku tuuma 15 ASD-ga patsientide ja 16 ajukoorest kontrollib geeni ekspressiooni enam kui 50 000 tuumas subjekti 0010010 # 39 ajus.

Pärast üksikute tuumade automaatset eraldamist piiskadeks, vöötkoodide märgistamist ja RNA järjestamist omistatakse saadud andmed automaatselt üksikutele rakkudele nende vöötkoodide põhjal, mis võimaldab rakutüüpe määrata nende võtmetähtsusega markergeenide ekspressiooni põhjal. Sel moel suutis Velmeshevi 0010010 # 39 meeskond tuvastada rakutüüpe, mille geeniekspressioon oli ASD-ga patsientide ja kontrollisikute vahel oluliselt erinev.

Nad leidsid, et ASD-ga patsientide proovides näitasid ülemise ajukoore neuronid kõige rohkem geenihäireid ning sünaptilises funktsioonis ja transkriptsioonis osalevad geenid olid kõige rohkem mõjutatud. Aju immuunsuses rolli omavatel mikrogliaalidel on ASD-ga patsientidel ka olulisi geneetilisi kõrvalekaldeid ning enim mõjutavad mikrogliaalsete aktivatsioonigeenide ja arengu transkriptsioonifaktori geenid.

Stanfordi ülikooli meditsiinikooli ASD-teadlane Dennis Wall (selle uue uurimistööga mitte seotud) ütles 0010010 quot; See on põnev edasiminek ning tundub, et see on väga mõistlik ja oluline uuring ... väga detailselt ja elegantselt lähenemisviis kirjeldab mõjutatud teid. See aitab esile tõsta valdkonda, kus on oodata täiendavaid uuringuid. 0010010 quot;

Ehkki Joseph Buxbaum Ameerika Ühendriikide Siinai mäe meditsiinikoolist Icahni meditsiinikoolist leiab, et 0010010 quot; see on elegantne uuring 0010010 quot;, on ta siiski mures valimi suuruse pärast. Ta ütles, et jah, tuuma võib olla rohkem kui 50 000, kuid need tulid ainult 15 patsiendilt. Ta jätkas, et see pole 0010010 quot; nende autorite süü on 0010010 quot; kuid kajastab 0010010 quot; selles valdkonnas suur probleem - väga piiratud ajuproovide 0010010 quot; põhiprobleem.

0010010 quot; ma usun täielikult, et kõik selles dokumendis on tõesed, kuid see ei pruugi olla universaalne. 0010010 quot;

Velmeshev nõustub, öeldes 0010010 quot; kindlasti on oluline reprodutseerida suuremas andmekogumis. 0010010 quot; Ta lisas: 0010010 quot; kui võrrelda meie proovide suures koguses geeniekspressiooni andmeid varem genereeritud andmetega ... Andmekogumite vahel on palju tavalisi ASD-ga seotud transkriptsioonimuutusi, 0010010 ; Ütles Kriegstein, ja avastus 0010010 quot; on väga julgustav. 0010010 quot; (saidilt bioon.com, koostage hsppharma.com)

Viide:

Dmitri Velmeshev jt. 0010010 nbsp;Üherakuline genoomika identifitseerib ravisüübispetsiifilised molekulimuutused autismis. Teadus, 2019, doi: 10. 1126 / science.aav 8130.